AVVISO DI CONSULTAZIONE PRELIMINARE DI MERCATO PROPEDEUTICA ALL’INDIZIONE DI UNA PROCEDURA NEGOZIATA SENZA PUBBLICAZIONE DI BANDO AI SENSI DELL’ART. 76 COMMA 2 LETTERA B), PUNTO 2 DEL D. LGS. 36/2023 PER L’AFFIDAMENTO DELLA FORNITURA DI UNA PIATTAFORMA DI SEQUENZIAMENTO AD ELEVATA PRODUTTIVITÀ BASATA SULLA TECNOLOGIA NANOPORE INCLUSI SERVIZI DI GARANZIA/MANUTENZIONE PER 24 MESI. CUP B53C2500370000
Value
Estimated€450,000 · 450,000 EUR
Awarded—
CPV codes
38970000 Laboratory, optical & precision equipmentDescription
Acquisizione di una Piattaforma di sequenziamento ad elevata produttività basata sulla tecnologia nanopore inclusi servizi di garanzia/manutenzione per 24 mesi . La strumentazione deve rispondere alle seguenti caratteristiche: piattaforma di sequenziamento basata sulla tecnologia Nanopore per il sequenziamento diretto di molecole native di DNA e RNA mediante letture lunghe (long-read); possibilità di eseguire il sequenziamento senza necessità di amplificazione PCR, sintesi del DNA o rilevazione ottica; identificazione diretta delle modificazioni epigenetiche del DNA e dell'RNA durante il processo di sequenziamento; elevata capacità di sequenziamento, idonea ad applicazioni genomiche e trascrittomiche su larga scala; acquisizione, basecalling ed elaborazione dei dati in tempo reale, con disponibilità immediata dei risultati durante l'esecuzione dell'esperimento; possibilità di eseguire contemporaneamente esperimenti indipendenti mediante flow cell dedicate e gestibili autonomamente; possibilità di interrompere il sequenziamento al raggiungimento della copertura desiderata e di recuperare la libreria per un successivo riutilizzo; possibilità di effettuare l'arricchimento o la deplezione selettiva di specifiche regioni genomiche direttamente durante il sequenziamento (Adaptive Sampling), senza ulteriori passaggi di preparazione delle librerie, amplificazione PCR o trattamenti chimici; sistema integrato comprendente il controllo della strumentazione, l'acquisizione dei dati, il basecalling, le analisi bioinformatiche primarie e la gestione del workflow di sequenziamento; piattaforma ad elevata produttività caratterizzata da un ingombro contenuto rispetto alle prestazioni offerte, tale da consentirne l'installazione in laboratori di ricerca senza la necessità di infrastrutture dedicate. La strumentazione esigenza dell’acquisto deve inoltre: permettere l'ottenimento di letture lunghe (long-read), idonee ad applicazioni genomiche, trascrittomiche ed epigenomiche avanzate; integrare l'acquisizione dei dati, il basecalling e le analisi bioinformatiche primarie in tempo reale, consentendo anche l'allineamento diretto delle sequenze ai genomi di riferimento durante l'esecuzione dell'esperimento; permettere l'esecuzione contemporanea di fino a 24 esperimenti completamente indipendenti mediante 24 flow cell dedicate, ciascuna gestibile autonomamente, consentendo l'avvio, l'interruzione, la sostituzione o il riutilizzo delle singole flow cell senza interferire con gli altri esperimenti in corso; consentire il sequenziamento di molecole native di DNA e RNA di dimensioni comprese tra circa 20 bp e milioni di basi, risultando idonea sia all'analisi di frammenti corti sia ad applicazioni basate su molecole ultra-lunghe; garantire una capacità produttiva fino a 200 Gb di dati per singola flow cell, consentendo di ottenere una copertura di circa 30× del genoma umano per ciascuna flow cell e risultando idonea ad applicazioni genomiche e trascrittomiche ad elevata complessità.
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